Journal des antiviraux et des antirétroviraux
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Abstrait

Comparaison de la charge virale du VIH-1 entre les méthodes Abbott m2000 et Roche COBAS TaqMan

Joseph Nkeze, Dong Liang, Heather Adkins et Richard Y. Zhao

La quantification précise de la charge virale du VIH-1 (CV) est essentielle pour la surveillance et la gestion de la maladie. Cette étude a été conçue pour comparer la détermination de la CV du VIH-1 entre deux des principales méthodes commerciales basées sur la PCR en temps réel, à savoir le test COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan HIV-1 de Roche et le test Abbott Real Time HIV-1 Assay. Sur 308 plasmas appariés testés, 85,1 % (262/308) des résultats de test étaient concordants, 173 échantillons étaient quantifiables pour la CV et 89 étaient « non détectés » (ND). Il y avait une forte corrélation globale de la CV quantifiable entre les deux méthodes (R2 = 0,952). La comparaison de la CV moyenne avec les différences des deux méthodes à l'aide du graphique de Bland Altman a montré une distribution symétrique approximative des différences, indiquant qu'aucune méthode n'est meilleure que l'autre pour mesurer la CV. Cependant, un pourcentage relativement élevé de 14,9 % (46/308) de résultats discordants a été constaté entre les deux méthodes. Le test ?2 de ces résultats discordants a indiqué une différence significative (?2 = 96,37 ; p = < 0,001). Sur les 104 échantillons ND Roche, 15 (14,4 %) ont été détectés par la méthode Abbott ; sur les 120 échantillons ND Abbott, 31 (25,8 %) ont été détectés par la méthode Roche. Les différences dans la cible génétique, la sensibilité du test, le volume d'entrée et leurs capacités à détecter différents sous-types du VIH-1 pourraient potentiellement expliquer une partie de la discordance.