Journal des antiviraux et des antirétroviraux
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Abstrait

Étude comparative de l'analyse phylogénétique du gène S1 des isolats du virus de la bronchite infectieuse d'Irak avec les souches sélectionnées (banque de gènes)

Noor R Abady*, Firas.Al-bawi

Récemment, en 2018, quatre souches du virus de la bronchite infectieuse (IBV) ont été isolées à partir de troupeaux de poulets de chair vaccinés et non vaccinés provenant de différentes fermes avicoles de différentes villes d'Irak. Les caractères pathogènes ont été évalués pour les quatre souches d'IBV. Les poulets testés ont été infectés par les quatre souches, ce qui a déclenché une réponse immunitaire. Des résultats notables ont été obtenus grâce à des tests de neutralisation croisée qui ont révélé que les souches étaient antigéniquement distinctes des souches classiques d'IBV H120, M41, Conn et Gray. Par rapport à la souche vaccinale H120, une courte insertion, une mutation ponctuelle et une délétion se sont produites à de nombreuses positions dans la protéine S1 des quatre souches. Deux des quatre souches présentaient le motif (HRRRR), qui était considéré comme identique à celui des souches épidémiques d'IBV en Irak. Deux autres souches présentaient de nouveaux motifs (HRLRR et RRYRR) apparus dans les souches isolées. Ces quatre souches étaient également génétiquement différentes des souches vaccinales et des souches IBV non irakiennes, mais étroitement apparentées à un grand nombre de souches américaines, chinoises, singapouriennes et indiennes. Les isolats et les 14 souches IBV de référence ont été regroupés en trois groupes distincts (I-III). Les quatre souches ont été classées dans le groupe III, formant une grande branche phylogénétique, qui est étroitement liée aux IBV américains et singapouriens, tandis que les souches vaccinales appartenant aux groupes I et II sont génétiquement éloignées des groupes III. Les résultats de cette étude indiquent que différentes souches IBV circulent dans la population de poulets en Irak.