Journal des antiviraux et des antirétroviraux
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Abstrait

Comorbidités des patients atteints de COVID-19 avec une faible valeur du seuil de cycle (Ct) du gène de la nucléocapside (N) : une application au modèle logistique basé sur les clusters

Sujan Rudra, Shuva Das, Md Ehsanul Hoque, Abul Kalam, Mohammad Arifur Rahman, Swagata Nandy Shizuka, Tazrina Rahman

Contexte : La maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) est une crise sanitaire mondiale. La méthode largement utilisée de réaction en chaîne par polymérase à transcriptase inverse en temps réel (rRT-PCR) est la plus à même de décrire l'état du patient. Les comorbidités peuvent aggraver la situation des patients.

Méthodes : Dans cette étude, nous avons mis en lumière la faible valeur du seuil de cycle (Ct) du gène N dans le test rRT-PCR des patients COVID-19 présentant des comorbidités, le taux de guérison et la nécessité d'une prise en charge en USI (unité de soins intensifs). Nous avons mené la recherche au laboratoire de biologie moléculaire du Chittagong Medical College entre mai et août 2020, puis nous avons mené l'entretien téléphonique avec 300 patients positifs qui remplissaient les critères de l'étude. Nous avons appliqué une régression logistique basée sur des clusters pour analyser les données.

Résultats : Une faible valeur Ct du gène N est retrouvée 1,324 fois plus élevée chez les patients atteints de diabète de type 2 et 1,871 fois plus élevée chez les patients hypertendus, et les patients hospitalisés sont 2,480 fois plus vulnérables au changement d'unité de soins intensifs.

Conclusion : Bien que l’infection par le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) provoque fréquemment des maladies graves, les cas suspects présentant des comorbidités doivent passer par la rRT-PCR le plus tôt possible.