Journal de chimie physique et biophysique
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Abstrait

Analyse bioinformatique de la phénylacétaldéhyde synthase (PAAS), une protéine impliquée dans la production du parfum des fleurs, chez la rose

Akbar Karami Samira Jandoust and Esmaeil Ebrahimie

Les fleurs de rose produisent et émettent des composés volatils aromatiques, le 2-phénylacétaldéhyde (PAA) et le 2-phényléthanol (2-PE), qui ont un parfum floral/de rose distinctif. Des études antérieures sur la rose ont montré que, comme pour les fleurs de pétunia, le PAA est formé à partir de la L-phénylalanine via la décarboxylase d'acide aminé L-aromatique dépendante du pyridoxal-5'-phosphate. La séquence de la phénylacétaldéhyde synthase de la rosa (RhPAAS) est homologue à la phénylacétaldéhyde synthase de la pétunia (PhPAAS). Comme il n'existe pas beaucoup de données expérimentales disponibles sur les différentes propriétés structurelles de cette protéine PAAS, dans la présente étude, nous avons étudié les différentes propriétés structurelles de la protéine PAAS dans le pétunia et le rosier à l'aide d'outils bioinformatiques. Les caractéristiques des structures première, secondaire et tertiaire de cette protéine ont été comparées entre le pétunia et le rosier. Les résultats ont montré que la fréquence de la leucine chargée négativement et la fréquence des dipeptides Ser-Leu, Pro-Glu, Phe-Ser et Thr-Thr chez le pétunia sont supérieures à celles du rosier. En revanche, chez le pétunia, les fréquences des résidus hydrophobes et hydrophiles, de l'hélice α, de la feuille β et des brins β du pétunia sont inférieures à celles du rosier. Les caractéristiques obtenues dans cette étude peuvent également fournir des indices utiles pour la conception de voies de production d'odeurs à l'aide de techniques d'ingénierie des protéines.