Journal of Glycomics & Lipidomics
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Abstrait

Un taux élevé de mutation génomique est à l'origine de la propagation réussie d'un génotype de Haarlem de la lignée 4 de Mycobacterium tuberculosis multirésistant

Naira Dekhil

Comprendre comment la tuberculose multirésistante (MDR-TB) émerge et se propage, en particulier dans un contexte séronégatif, pourrait aider à déchiffrer les facteurs contributifs inhérents au bacille. Nous avons exploré en profondeur la structure de la population du génotype Haarlem de la lignée 4 (L4) de Mycobacterium tuberculosis dans le nord de la Tunisie, où il a provoqué dès le début une épidémie majeure de MDR-TB chez les jeunes individus séronégatifs. À cette fin, nous avons assuré une couverture complète du génotype Haarlem sur 11 ans dans la région épidémique en analysant tous les isolats de M. tuberculosis présentant la signature du spoligotype Haarlem (N = 253). Nous avons effectué un typage MIRU-VNTR (multiple interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat) sur 24 loci et séquencé le génome entier de 94 isolats représentatifs. Diverses analyses génétiques de population et évolutives ont ensuite été réalisées. Nous avons révélé la propension du génotype de Haarlem à subir une propagation épidémique, indépendamment du profil de sensibilité aux médicaments (taux de transmission global récent de 83 %). L'épidémie globale de TB-MR était liée à un seul clone progéniteur sensible aux médicaments, dont l'existence remontait à 124 ans. De manière frappante, un taux de mutation global élevé proche de celui de la sous-lignée L2-Beijing répandue à l'échelle mondiale a été estimé, un résultat en accord avec l'acquisition presque simultanée de résistances multiples aux médicaments et de mutations compensatoires. Un taux de mutation aussi élevé explique également le nombre élevé de différences nucléotidiques entre les génomes d'isolats provenant de patients ayant des liens épidémiologiques directs établis. En conclusion, nos données ont révélé le taux de mutation relativement élevé du génotype de Haarlem évoluant dans le nord de la Tunisie, une caractéristique inhérente qui a très probablement contribué à l'émergence de clones MDR transmis avec succès par l'acquisition rapide de mutations compensatoires. S'il n'est pas contenu, ce clone de Haarlem en évolution rapide, qui reste actuellement géographiquement confiné, pourrait représenter une menace pour l'espace euro-méditerranéen.