Recherche immunitaire

Recherche immunitaire
Libre accès

ISSN: 1745-7580

Abstrait

La structure des immunoglobulines permet de contrôler le mouvement des CDR

Michael T. Zimmermann, Aris Skliros, Andrzej Kloczkowski et Robert L. Jernigan

Les mouvements de la structure IgG sont évalués à l'aide d'une analyse en mode normal d'un modèle de réseau élastique pour détecter les charnières, la dominance des modes à basse fréquence et les mouvements internes les plus importants. Une question à laquelle nous cherchons à répondre est de savoir si les mouvements de charnière IgG facilitent ou non la liaison à l'antigène. Nous évaluons également les effets des cristaux et de l'emballage des protéines sur les facteurs de température expérimentaux et les prédictions de désordre. Nous constatons que les effets de l'environnement protéique sur les facteurs de température cristallographiques peuvent être trompeurs pour évaluer les mouvements fonctionnels spécifiques de l'IgG. L'étendue du mouvement des domaines de liaison à l'antigène est calculée pour montrer leur large échantillonnage spatial. Nous concluons que la structure IgG est spécifiquement conçue pour faciliter de grandes excursions des domaines de liaison à l'antigène. Les modes normaux sont montrés comme capables d'évaluer par calcul les mouvements de charnière et l'échantillonnage spatial par la structure. Les boucles de liaison à l'antigène et la charnière principale semblent se comporter de manière similaire au reste de la structure lorsque nous considérons la dominance des modes à basse fréquence et l'étendue du mouvement interne. La structure complète de l'IgG a une dimension spectrale inférieure à celle des domaines Fab individuels, ce qui indique un transfert d'informations plus efficace à travers l'anticorps qu'à travers chaque domaine. Cela confirme l'hypothèse selon laquelle la structure de l'IgG est spécifiquement conçue pour faciliter la liaison à l'antigène en couplant le mouvement des boucles de liaison à l'antigène avec les mouvements de charnière à grande échelle.

Clause de non-responsabilité: Ce résumé a été traduit à l'aide d'outils d'intelligence artificielle et n'a pas encore été révisé ou vérifié.
Top